《幽灵公主》讲述室町时代时期虾夷族少年阿席达卡，在保卫他的村庄时被一恶魔诅咒受不治创伤。村里的巫婆劝他前往西方，寻找邪魔的来源和解除诅咒的方法。在他的旅途中，他来到山兽神森林，认识了被称为魔法公主的、由狼神抚养大的小桑（港译：阿珊）。 在这个过程中，阿席达卡发现邪魔本来是一个山猪神，但体内中了一颗铁弹后 ，对人类憎恨无比，变成了邪魔。铁弹是工业之城达达拉的统治者黑帽大人领导的穷人在铁城里制造的，为了保护自己不被贪心的封建贵族吞并，黑帽大人使用火器和铁弹作为武器，而为了制造火器和铁弹，她又必须从大自然中开发木头和铁矿石，由此与原始森林中的兽神交恶。 阿席达卡试图在双方调停，但却越来越深地被牵入了这场冲突。